EnglishFrenchSpanish

Jalankan server | Ubuntu > | Fedora > |


favorit OnWorks

micro_razers - Online di Cloud

Jalankan micro_razers di penyedia hosting gratis OnWorks melalui Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows, atau emulator online MAC OS

Ini adalah perintah micro_razers yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS

PROGRAM:

NAMA


micro_razers

RINGKASAN

micro_razers [OPSI]

DESKRIPSI

MicroRazerS menggunakan strategi pemetaan berbasis awalan untuk memetakan kemungkinan pembacaan RNA kecil
berisi urutan adaptor 3'.

(c) Hak Cipta 2009 oleh Anne-Katrin Emde.

-h, --membantu

Menampilkan pesan bantuan ini.

--Versi: kapan

Menampilkan informasi versi

Pilihan Utama::

-o, --keluaran FILE

Ubah nama file keluaran. Bawaan: .hasil.

-rr, --recognition-rate NUM

mengatur tingkat pengenalan persen Dalam kisaran [80..100]. Standar: 100.

-sL, --seed-length NUM

panjang benih Dalam kisaran [10..inf]. Standar: 16.

-sE, --seed-error

izinkan satu kesalahan dalam seed

-f, --maju

peta hanya membaca untuk meneruskan untaian.

-r, --membalikkan

peta hanya membaca untuk membalikkan untaian.

-M N, --pertandingan-N

'N' cocok dengan semua karakter lain

-m, --max-hits NUM

hanya menghasilkan NUM hits terbaik Dalam rentang [1..inf]. Standar: 100.

-pa, --membersihkan-ambigu

bersihkan bacaan dengan lebih dari kecocokan terbaik terbaik

-lm, --memori rendah

kurangi penggunaan memori dengan mengorbankan runtime

-v, --verbose

mode verbose

-vv, --vverbose

mode yang sangat bertele-tele

Opsi Format Keluaran::

-dari, --format output NUM

Mengatur format keluaran. 0 = format MicroRazerS, 1 = SAM. Dalam kisaran [0..1].

-a, --penyelarasan

buang keselarasan untuk setiap pertandingan

-gn, --penamaan genom NUM

Pilih bagaimana genom diberi nama. 0 = gunakan Fasta id, 1 = enumerate dimulai dengan 1. In
rentang [0..1]. Standar: 0.

-rn, --baca-penamaan NUM

Pilih bagaimana bacaan diberi nama. 0 = gunakan Fasta id, 1 = enumerate dimulai dengan 1. In
rentang [0..1]. Standar: 0.

-jadi, --urutan-urutan NUM

Pilih bagaimana kecocokan diurutkan. 0 = nomor baca, 1 = posisi genom. Dalam lingkup
[0..1]. Standar: 0.

-pf, --posisi-format NUM

Pilih penomoran posisi awal/akhir (lihat bagian Koordinat di bawah). 0 = ruang celah,
1 = ruang posisi. Dalam kisaran [0..1]. Standar: 0.

VERSION

versi micro_razers: 1.0.1 Pembaruan terakhir Juli 2009

Gunakan micro_razers online menggunakan layanan onworks.net


Ad


Ad