Ini adalah perintah positionDB yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
positionDB - pengelolaan file posDB
RINGKASAN
posisiDB [-ukuran besar k] [-merskip k] [-menggunakan a-b,c] [-mulai b] [-merend e] -urutan
s.fasta -keluaran hal.posDB
posisiDB -membuang file data
posisiDB -tes1 sequence.fasta
posisiDB -tes2 db.fasta sequence.fasta
PILIHAN
Bangunan an gambar
-ukuran besar k
Ukuran mer, default=20.
-merskip k
Lewati antara mer, default=0
-menggunakan a-b,c
Tentukan urutan mana yang akan digunakan, default=all
-mulai b
Bangun subset dari mer, mulai dari mer #b, default=all mers
-merend e
Membangun subset dari mer, berakhir di mer #e, default=all mers
-urutan s.fasta
Urutan masukan.
-keluaran hal.posDB
Nama file keluaran.
Dumping informasi tentang an gambar
-membuang file data.posDB
Running kewarasan tes
-tes1 sequence.fasta
Menguji apakah setiap mer ditemukan di posisiDB. Laporkan jika tidak menemukan
mer pada posisi yang benar. Tidak melaporkan jika tabel memiliki terlalu banyak barang.
-tes2 db.fasta sequence.fasta
Membangun sebuah posisiDB dari db.fasta, lalu mencari tabel untuk setiap mer di
sequence.fasta. Melaporkan semua mer yang ditemukannya.
Ini adalah tes konyol dan Anda tidak boleh melakukannya.
Gunakan positionDB online menggunakan layanan onworks.net
