Ini adalah pimol perintah yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
pymol - paket pemodelan dan grafik molekuler gratis dan fleksibel
RINGKASAN
pimol [Pilihan] [arsip]
DESKRIPSI
Selama bertahun-tahun, PyMOL telah menjadi penampil molekuler yang mumpuni dengan dukungan untuk animasi,
rendering berkualitas tinggi, kristalografi, dan aktivitas grafis molekuler umum lainnya.
Ini telah diadopsi oleh ratusan (bahkan mungkin ribuan) ilmuwan yang tersebar
tiga puluh negara. Namun, PyMOL masih dalam proses, dengan pengembangan
diperkirakan akan terus berlanjut untuk tahun-tahun mendatang.
PILIHAN
Opsi ini saat ini didukung:
-2 Mulai dalam mode mouse dua tombol.
-c Mode baris perintah, tanpa GUI. Untuk operasi batch.
-d string
Jalankan string perintah pymol saat startup.
-e Mulai dalam mode layar penuh.
-f #garis
Mengontrol tampilan perintah dan umpan balik di OpenGL (0=lepas).
-g file.png
Tulis file PNG (setelah mengevaluasi argumen sebelumnya)
-i Nonaktifkan GUI OpenGL internal (daftar objek, menu, dll.)
-l file.py
Munculkan program python di utas baru.
-o Nonaktifkan perlindungan keamanan untuk file sesi.
-p Dengarkan perintah pada input standar.
-q Peluncuran yang tenang. Menekan layar splash & obrolan lainnya.
-r file.py
Jalankan program Python (dalam __utama__) Pada mulanya.
-s naskah
Simpan perintah ke skrip PyMOL atau file program ini.
-t Gunakan modul GUI eksternal berbasis Tcl/Tk (pmg_tk).
-u naskah
Muat dan tambahkan ke skrip PyMOL atau file program ini.
-x Nonaktifkan modul GUI eksternal.
-B Aktifkan sinyal stereo garis biru (untuk stereo Mac)
-G Mulai dalam mode Permainan.
-M Paksa mono bahkan saat stereo perangkat keras ada.
-R Luncurkan pendengar XMLRPC Greg Landrum.
-S Paksa dan luncurkan dalam stereo, jika memungkinkan.
-X int -Y int -W int -H int -V int
Sesuaikan geometri jendela.
Semua arsip disediakan akan dimuat atau dijalankan setelah PyMOL dimulai. Mereka dapat memiliki salah satu dari
ekstensi berikut:
.pml skrip perintah PyMOL untuk dijalankan saat startup
.py[cm] Program Python untuk dijalankan saat startup
File format .pdb Protein Data Bank yang akan dimuat saat startup
Format .mmod Macromodel untuk dimuat saat startup
.mol file MDL MDL yang akan dimuat saat startup
File .sdf MDL SD untuk diurai dan dimuat saat startup
File .xplor X-PLOR Map (ASCII) akan dimuat saat startup
File peta .ccp4 CCP4 (BINARY) akan dimuat saat startup
.cc[12] File koordinat kartesius 3D ChemDraw
.pkl Model ChemPy Acar (kelas "chempy.model.Diindeks")
File .r3d Raster3D
.cex file CEX (Metafora)
.top file topologi AMBER
.crd file koordinat AMBER
. file mulai ulang AMBER pertama
.trj lintasan AMBER
.pse file sesi PyMOL
.phi Delphi/Pegang Peta Potensi Elektrostatik
Untuk daftar opsi, Anda juga dapat memasukkan yang berikut ini di baris perintah pimol:
membantu peluncuran
PERINTAH
Silakan merujuk ke dokumentasi online PyMols di
http://www.pymolwiki.org/index.php/Category:Perintah atau bantuan internalnya untuk sebuah perintah
referensi.
Gunakan pymol online menggunakan layanan onworks.net
