Ini adalah aplikasi Linux bernama CAMPARI yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai campari_v4_12202020.zip. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama CAMPARI dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
CAMPARI
Ad
DESKRIPSI
Kami dengan bangga memperkenalkan CAMPARI versi 4. Mempertahankan filosofi yang diperkenalkan dengan V3 untuk mempercepat (hampir) semuanya dengan bantuan OpenMP (paralelisme utas), kami telah menambahkan sejumlah algoritme baru dari literatur terbaru, terutama seluruh modul yang menangani molekul kecil kimia arbitrer untuk aplikasi dalam docking komputasi dan desain obat. Secara alami, CAMPARI terus memberikan implementasi referensi dari paradigma medan gaya ABSINTH dan model solvasi implisit.
CAMPARI adalah paket bersama untuk melakukan dan menganalisis simulasi molekuler, khususnya sistem relevansi biologis. Ini berfokus pada ketersediaan luas algoritme untuk pengambilan sampel (lanjutan) dan mampu menggabungkan Monte Carlo dan dinamika molekul dengan cara yang mulus. CAMPARI menawarkan kepada pengguna tingkat kontrol yang sangat tinggi atas semua fitur yang diterapkan. Untuk informasi dan fitur lebih lanjut, silakan merujuk ke beranda proyek di http://campari.sourceforge.net.
Fitur
- Pengambilan sampel MC dan MD gabungan, MD dalam ruang Cartesian atau torsional / benda kaku
- Paralelisasi OpenMP yang efisien dari semua energi inti/rutinitas kekuatan
- Analisis atau eksekusi on-the-fly sebagai alat analisis lintasan (juga secara paralel)
- Banyak rutinitas analisis bawaan (DSSP, peta kontak, fungsi korelasi pasangan, dll.)
- Dukungan untuk beberapa pengelompokan struktural dan algoritme terkait bersama dengan analisis model status Markov
- Fasilitas analisis yang berdiri sendiri untuk fasilitas model status pengelompokan/Markov
- Didokumentasikan sepenuhnya (html) dan sebagai tambahan dikirimkan dengan 16 tutorial
- Tingkat kontrol yang sangat tinggi atas hampir semua fitur yang didukung
- Dukungan luas untuk teknik simulasi multi-replika paralel seperti pertukaran replika dalam eksekusi paralel MPI/OpenMP hybrid
- Dukungan untuk aplikasi penyaringan molekul kecil dengan parameterisasi otomatis sebagian
- Dukungan untuk banyak potensi bias (jarak, posisi, torsi, struktur sekunder, kepadatan spasial, kompartementalisasi, sifat polimer)
Para penonton
Sains/Penelitian
User interface
Konsol/Terminal
Bahasa Pemrograman
Fortran
KATEGORI
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/campari/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
