Ini adalah aplikasi Linux bernama ChIP-RNA-seqPRO untuk dijalankan di Linux online yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai cloudclientID.zip. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama ChIP-RNA-seqPRO ini untuk dijalankan di Linux online dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
ChIP-RNA-seqPRO untuk dijalankan di Linux online
DESKRIPSI
ChIP-RNA-seqPRO: Strategi untuk mengidentifikasi daerah deregulasi epigenetik yang terkait dengan penyambungan transkrip yang menyimpang dan situs pengeditan RNA. Skrip python yang dapat dijalankan dikemas bersama dengan pustaka anotasi yang disesuaikan, input data demo, dan panduan README.9/26 : v1.1 Memperbarui MAIN_IV untuk men-debug kesalahan yang dilontarkan oleh python panda yang tidak lagi mendukung 'subset'.
Kode ini tidak akan lagi dipertahankan/diperbarui secara aktif di sini. Sumber daya berbasis cloud untuk analisis komparatif epigenetik, variasi urutan, dan kumpulan data ekspresi kini tersedia. Silakan kunjungi Cloudomics, proyek untuk sumber daya berbasis cloud: https://sourceforge.net/projects/cloudomics-for-aws/
Fitur
- Alat untuk analisis komparatif dari berbagai epigenomik (ChIPseq, MBDseq, dll.) dan sekuensing berbasis RNA set data sampel berpasangan
- Jika Anda menggunakan alat ini atau perpustakaan anotasi mana pun, harap sertakan referensi berikut: Champion M., Hlady R., Yan H., Evans J., Nie J., Lee J., Bogenberger J., Nandakumar K., Davila J., Moore R., Nair A., O'Brien D., Zhu Y., Kortüm K., Ordog T., Zhang Z., Joseph R., Kocher J., Jonasch E., Robertson K., Tibes R. dan H. Ho T. (2015). Strategi Bioinformatika untuk Mengidentifikasi Daerah Deregulasi Epigenetik yang Berhubungan dengan Penyambungan Transkrip Aberrant dan penyuntingan RNA. Dalam Prosiding Konferensi Internasional Model, Metode dan Algoritma Bioinformatika, halaman 163-170. DOI: 10.5220/0005248001630170
Para penonton
Sains/Penelitian
Bahasa Pemrograman
Unix Shell, Phyton
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/chiprnaseqpro/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
