Ini adalah aplikasi Linux bernama Cstone yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai cstone.zip. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama Cstone dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
Cstone
DESKRIPSI
Cstone adalah assembler de novo untuk data RNA-Seq yang menggunakan de Bruijn seperti grafik dan membubuhi keterangan setiap contig yang dihasilkan dengan salah satu dari tiga tingkat klasifikasi grafik yang menunjukkan apakah dapat dijamin non chimeric atau tidak. Tingkat klasifikasi tergantung pada kompleksitas keluarga gen dari mana bacaan berasal. Sebagai produk sampingan, ini juga memberikan wawasan tentang susunan struktural dari keluarga gen yang mendasari yang telah diurutkan. Rincian lebih lanjut akan segera tersedia dalam makalah kami: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34813594/.
Fitur
- Perakitan de novo data RNA-Seq.
- Identifikasi contigs non-chimeric.
- Kompatibilitas lintas platform.
- Jar yang dapat dieksekusi tersedia.
- Tidak diperlukan paket eksternal.
- Kode mudah diikuti dan dimasukkan ke alat lain.
- Informasi tentang kompleksitas keluarga gen yang mendasarinya.
- de Bruijn menyukai pendekatan (lebih lunak).
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/cstone/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
