Ini adalah aplikasi Linux bernama EXCAVATOR-tool untuk dijalankan di Linux online yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai EXCAVATOR_Package_v2.2.tgz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan online aplikasi ini bernama EXCAVATOR-tool untuk dijalankan di Linux online dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
EXCAVATOR-alat untuk dijalankan di Linux online
DESKRIPSI
PERHATIAN!!!!!PERHATIAN!!!!!PERHATIAN!!!!!PERHATIAN!!!!!Kami baru-baru ini menerbitkan di BMC Genomics paket perangkat lunak baru, bernama XCAVATOR, untuk identifikasi CNV/CNA dari percobaan pengurutan seluruh genom yang dibaca pendek dan panjang (https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-4137-0).
XCAVATOR tersedia secara gratis di http://sourceforge.net/projects/xcavator/.
EXCAVATOR adalah paket perangkat lunak baru untuk mendeteksi varian nomor salinan (CNV) dari data sekuensing seluruh exome.
EXCAVATOR telah diterbitkan di Genome Biology (http://genomebiology.com/2013/14/10/R120/abstract).
#####################
PERHATIAN!!!!! Untuk menggunakan alat EXCAVATOR dengan benar, pengguna harus mengunduh file mappability uniqueome di tautan berikut:
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg19_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz (untuk hg19)
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg18_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz
Fitur
- Urutan Generasi Berikutnya
- Salin Nomor Varian
- Seluruh Urutan Exome
Bahasa Pemrograman
Perl
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/excavatortool/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.