Ini adalah aplikasi Linux bernama ForceGen yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai ForceGenV0.4.jar. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama ForceGen dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
Jenderal Angkatan
DESKRIPSI
Silakan kutip:ForceGen: derivasi konstanta ikatan kovalen atom untuk Gromacs. Nash A, Collier T, Birch HL, de Leeuw NH. Jurnal Pemodelan Molekuler (2018), (24)5. DOI: 10.1007/s00894-017-3530-6
video instruksi:
https://youtu.be/fQVXv8Ge_tg
Jar yang dapat dieksekusi Java ini memperoleh konstanta gaya ikatan orde dua untuk regangan ikatan dan sudut ikatan dari perhitungan Gaussian mekanika kuantum. Perhitungannya sesuai dengan keluarga medan gaya Amber atau medan gaya apa pun yang diturunkan dari tensor orde kedua Hessian dari fragmen molekul. Output telah dibuat kompatibel dengan format topologi Gromacs.
Contoh penggunaan termasuk penurunan konstanta gaya ikatan dan nilai keseimbangan untuk:
-logam terikat di situs aktif protein
-asam amino termodifikasi
-molekul kecil/molekul obat
Zip file contoh dapat ditemukan dengan mengikuti tautan "Jelajahi Semua File".
Ditulis oleh Dr Anthony Nash (Oxford)
Didukung oleh Dr Thomas Collier, Prof Helen Birch &
Fitur
- Derivasi konstan kekuatan regangan ikatan
- Derivasi konstan gaya sudut ikatan
- Kompatibilitas dengan topologi Gromacs
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/forcegen/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
