Ini adalah aplikasi Linux bernama FusionCatcher yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai fusioncatcher_v1.33.zip. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama FusionCatcher dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Penangkap Fusi
Ad
DESKRIPSI
FusionCatcher mencari gen fusi somatik baru/diketahui, translokasi, dan chimera dalam data RNA-seq (pembacaan akhir berpasangan dari platform Illumina NGS seperti Solexa dan HiSeq) dari sampel yang sakit.
Tujuan FusionCatcher adalah:
- tingkat deteksi yang sangat baik untuk menemukan kandidat gen fusi,
- sangat mudah digunakan (yaitu tidak diperlukan pengetahuan apriori tentang database dan bioinformatika untuk menjalankan FusionCatcher),
- deteksi yang sangat baik dari gen fusi yang menantang, seperti misalnya fusi IGH, fusi CIC, fusi DUX4, fusi CRLF2, fusi TCF3, dll.
- seotomatis mungkin (yaitu FusionCatcher akan memilih secara otomatis parameter terbaik untuk menemukan kandidat gen fusi, misalnya menemukan adaptor secara otomatis, membangun sambungan ekson-ekson secara otomatis berdasarkan panjang pembacaan input, dll.) sambil memberikan tingkat deteksi terbaik untuk menemukan gen fusi.
Para penonton
Sains/Penelitian
Bahasa Pemrograman
Ular sanca
KATEGORI
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/fusioncatcher/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
