Ini adalah aplikasi Linux bernama HSRA yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai HSRA-v1.1.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama HSRA dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
HSRA
Ad
DESKRIPSI
HSRA adalah alat paralel berbasis MapReduce untuk pemetaan bacaan dari percobaan RNA sequencing (RNA-seq). Analisis RNA-seq biasanya dimulai dengan memetakan bacaan ke genom referensi untuk menentukan lokasi asal bacaan, yang merupakan langkah yang sangat memakan waktu. Alat ini memungkinkan peneliti bioinformatika untuk secara efisien mendistribusikan tugas pemetaan mereka di atas node cluster dengan menggabungkan fast multithreaded spliced aligner (HISAT2) dengan Apache Hadoop, yang merupakan kerangka kerja komputasi terdistribusi untuk pemrosesan Big Data yang dapat diskalakan.
HSRA saat ini mendukung perataan baca ujung tunggal dan ujung berpasangan dari kumpulan data FASTQ/FASTA. Selain itu, alat kami menggunakan perpustakaan Hadoop Sequence Parser (HSP) (tautan di atas) untuk membaca kumpulan data input yang disimpan di Hadoop Distributed File System (HDFS) secara efisien, karena mampu memproses kumpulan data yang dikompresi dengan codec Gzip dan BZip2.
Para penonton
Teknologi Informasi, Industri Kesehatan, Sains/Penelitian
User interface
Konsol/Terminal, Baris Perintah
Bahasa Pemrograman
Jawa
KATEGORI
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/hsra/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
