Ini adalah aplikasi Linux bernama IPGWAS yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai ipgwas3.0.5.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama IPGWAS dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
IPGWAS
DESKRIPSI
Pipeline Terintegrasi untuk Studi Asosiasi Genome-WideFitur
- studi asosiasi genome-wide (GWAS)
- kontrol kualitas (qc)
- Plot Manhattan dan Plot QQ
- Tes tren Cochran-Armitage, tes Asosiasi
- gabungkan kumpulan data GWAS, Pisahkan Data GWAS dengan Kromosom
- Ubah chi-kuadrat keluaran EIGENSTRAT menjadi nilai p
- Konversi keluaran imputasi MACH ke format PED/MAP dan format SNPTEST
- Konversi file PED/MAP ke format input default PHASE dan BEAGLE
- Konversikan file PLINK dan SNPTEST ke format GWAMA
- Kalkulator Nilai-P (uji Chi-kuadrat, uji tren Cochran-Armitage, dan uji eksak Fisher)
- Ubah status kasih sayang dari data GWAS
- saring Subyek data GWAS berdasarkan status afeksi (kasus/kontrol) dan/atau jenis kelamin (laki-laki/perempuan)
- GUI untuk PLINK, Tes rasio SNP
- menyaring SNP tunggal yang signifikan
- eigPlot (plot hasil eigenstrat)
- Konversikan file PED/MAP ke format input default MACH dan IMPUT2
- Konversikan keluaran imputasi IMPUTE2 ke format TPED/TFAM (PLINK)
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/ipgwas/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
