Ini adalah aplikasi Linux bernama Javamony untuk dijalankan di Linux online yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai Javamony.jar. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan online aplikasi bernama Javamony ini untuk dijalankan di Linux online dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
Javamony untuk dijalankan di Linux online
DESKRIPSI
Berdasarkan Pysimony yang tidak terlalu sukses (https://sourceforge.net/projects/pysimony/), siswa yang sama bertekad untuk mencoba lagi masalah filogenetik.Javamony dipanggil sebagai berikut:
java -jar Javamony.jar [input.fasta] [acak / bertahap (pohon awal)] [# bootstrap] [takson grup luar #1] [takson grup luar #2] ...
Tidak dimaksudkan sebagai program inferensi filogenetik kompetitif, Javamony adalah kesempatan bagi saya untuk memperoleh bahasa Java sambil belajar untuk mengatasi dan memecahkan masalah mendasar dalam filogenetik. Oleh karena itu, untuk kepentingan pendidikan saya sendiri, semua kode adalah asli. Tentu saja, mungkin ada banyak kesalahan juga.
Saya mendistribusikan Javamony, seperti yang saya lakukan Pysimony, berharap bahwa itu akan menjadi nilai pendidikan untuk orang lain atau setidaknya agak lucu.
Fitur yang akan datang adalah:
- Dukungan untuk urutan Asam Amino
- Dukungan untuk format file tambahan (misalnya Nexus)
- Multithread
- Metode penilaian tambahan (misalnya kemungkinan maksimum)
Fitur
- Menggunakan penghematan maksimum
- Membaca file input FASTA (hanya DNA)
- Grup luar yang dibuat pengguna
- Pohon awal acak dan penambahan bertahap
- Menggunakan pencarian pohon SPR (subtree pruning and regrafting)
- Melakukan bootstrap
- Menghasilkan format Newick standar dengan dukungan bootstrap dan panjang cabang
- Menggambar pohon terakhir dengan dukungan bootstrap
Para penonton
Sains/Penelitian, Pendidikan
User interface
Garis komando
Bahasa Pemrograman
Jawa
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/javamony/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.