Ini adalah aplikasi Linux bernama mitoMaker yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai mitoMaker_1.0rc2.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama mitoMaker dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
pembuat mito
DESKRIPSI
Mitomaker adalah pembungkus pipeline, penganalisis hasil, dan annotator otomatis, yang ditulis dalam Python v2.7, yang, dengan bantuan program lain, membangun, menganalisis, mencari build terbaik dan membuat anotasi genom target (seperti mitokondria dan cloroplast). Ini dapat digunakan dengan target lain, seperti gen tertentu, atau transkriptom, meskipun itu bukan tujuan utama, atau diuji secara menyeluruh.
Setelah berbagai upaya untuk membangun genom mitokondria yang berbeda di lab yang saya pelajari, jalur umum mulai muncul: merakit bacaan dengan MIRA atau SOAPdenovo-Trans, mencari perancah/contig yang cocok dengan spesies yang terkait erat, periksa untuk melihat apakah semua fitur genomik yang diharapkan hadir (karena mitokondria dilestarikan dengan baik), periksa untuk melihat apakah rakitan mungkin telah melingkar (karena itu adalah DNA melingkar). Jika ada fitur yang hilang, atau belum disirkulasikan, coba dan rakit lagi dengan parameter assembler yang berbeda (terutama k-mer). Bilas dan ulangi sampai build terbaik ditemukan.
Fitur
- Bioinformatika
- Pipa otomatis bangunan plastid
- Penganalisis genom
- Perakitan plastid
Para penonton
Sains/Penelitian
User interface
Konsol/Terminal
Bahasa Pemrograman
Ular sanca
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/plastidmaker/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
