Ini adalah aplikasi Linux bernama MoPAC yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai MoPAC_0.3.1.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama MoPAC dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
MoPAC
DESKRIPSI
Untuk memfasilitasi perbandingan esensialitas gen dalam dua atau lebih sampel sel, kami mengusulkan MoPAC (Modular Pipeline for Analysis of CRISPR screens), alat interaktif yang digerakkan oleh Shiny untuk analisis esensialitas diferensial di layar CRISPR/Cas9.
Untuk petunjuk pemasangan dan penggunaan, silakan merujuk ke halaman wiki.
Fitur
- Pengukuran esensialitas gen diferensial yang tidak bias di layar CRISPR.
- Kemudahan penggunaan melalui interfase pengguna grafis interaktif.
- Angka siap publikasi dihasilkan pada setiap langkah analisis.
- File FASTQ dan tabel read-count (sebelum atau setelah normalisasi) diperbolehkan sebagai input.
- Kontrol kualitas berbasis kategori gen untuk deteksi dan pemfilteran outlier.
- Analisis ontologi gen bawaan melalui paket STRINGdb R.
- Pemrosesan cepat melalui kompilasi C++ dari langkah-langkah perhitungan intensif.
Para penonton
Sains/Penelitian
User interface
Berbasis web-
Bahasa Pemrograman
C++, S/R
KATEGORI
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/mopac/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
