Ini adalah aplikasi Linux bernama Protospacer Workbench yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai Protospacer_Workbench.MacOSX.64bit.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama Protospacer Workbench with OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
Meja Kerja Protospacer
DESKRIPSI
Protospacer Workbench membantu merancang, menganalisis, dan berbagi situs target CRISPR untuk organisme apa pun atau kumpulan urutan berformat FASTA.Desain RNA pemandu untuk sistem pengeditan genom CRISPR/Cas secara intuitif mudah, tetapi sulit secara komputasi. Kesulitan utama muncul dari kebutuhan untuk mengidentifikasi potensi off-target yang mungkin sangat berbeda dari target yang dimaksudkan. Alat online saat ini untuk desain panduan-RNA menyediakan antarmuka yang ramah pengguna untuk perangkat lunak pemetaan urutan seperti Bowtie atau BLAST. Namun, meskipun cepat, algoritme pemetaan ini tidak dirancang dengan toleransi kesalahan yang tinggi, fitur yang penting untuk menentukan potensi target yang tidak tepat. Di mana alat online gagal, alat offline berhasil. Namun, alat offline memerlukan pengetahuan tentang baris perintah yang hanya dimiliki sedikit orang, yang menggunakan CRISPR. Protospacer Workbench bertujuan untuk menjembatani kesenjangan antara desain RNA panduan online dan offline. Perangkat lunak saat ini tersedia untuk OS X dan akan segera di-porting ke sistem operasi lain.
Fitur
- Temukan semua target CRISPR yang tersedia dengan cepat
- Evaluasi desain guide-RNA secara menyeluruh
- Bagikan target dan daftar panduan-RNA
- Desain untuk organisme apa pun
- Kelola banyak database
- Alur kerja langkah demi langkah
- Dapatkan laporan tentang kinerja panduan-RNA yang diharapkan
- Manfaatkan beberapa alat pihak ketiga dari satu antarmuka
- Desain multi-target
- Kelola daftar target/panduan-RNA yang besar
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/protospacerwb/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
