Ini adalah aplikasi Linux bernama sgRNAcas9 yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai sgRNAcas9_3.0.5.zip. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan aplikasi ini secara online bernama sgRNAcas9 dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
sgRNAcas9
DESKRIPSI
Paket ini terdiri dari program untuk melakukan pencarian situs target CRISPR (protospacer) dengan parameter yang ditentukan pengguna, memprediksi situs pembelahan potensial di luar target (POT) Cas9 di seluruh genom, mengklasifikasikan POT ke dalam tiga kategori, oligonukleotida desain batch untuk membangun 20 -nt (nukleotida) atau vektor ekspresi sgRNA terpotong, ekstrak urutan nukleotida panjang yang diinginkan yang mengapit situs pembelahan on- atau off-target untuk merancang pasangan primer PCR untuk memvalidasi mutasi dengan uji pembelahan T7E1. Yang penting, dengan mengidentifikasi situs off-target potensial di silico, sgRNAcas9 memungkinkan pemilihan situs target yang lebih spesifik dan membantu identifikasi situs off-target yang bonafid, secara signifikan memfasilitasi desain sgRNA untuk aplikasi pengeditan genom.Mengutip: Xie S, ShenB,Zhang C, Huang X, Zhang Y. sgRNAcas9: paket perangkat lunak untuk merancang sgRNA CRISPR dan mengevaluasi potensi situs pembelahan di luar target. PLoS Satu. 2014,9(6):e100448.
http://www.biootools.com/
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/sgrnacas9/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
