Ini adalah aplikasi Linux bernama UniPyRange untuk dijalankan di Linux online yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai UniPyRangeSuite.py. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama UniPyRange ini untuk dijalankan di Linux online dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
UniPyRange untuk dijalankan di Linux online
DESKRIPSI
Skrip python yang sangat sederhana yang menyelamatkan Anda dari kesulitan menghitung asam amino/basa DNA dalam file fasta dari Basis Data RefSeq Uniprot dan NCBI (1, 2).Katakanlah Anda menginginkan urutan asam amino kisaran 128-387 dari protein asam amino 1000 - skrip ini akan membantu Anda menghindari kesalahan penghitungan dengan hanya menunjukkan urutan yang ditentukan dalam asam amino dan mengkode pasangan basa DNA (ideal untuk desain primer amplifikasi ) dari ID Uniprot yang ditentukan.
- Memerlukan Paket BioPython (3) dan Bioservices (4)
(1)
Konsorsium UniProt
UniProt: pusat informasi protein
Asam Nukleat Res. 43: H204-H212 (2015).
(2)
RefSeq: pembaruan pada urutan referensi mamalia. Asam Nukleat Res. 2014 1 Januari;42(1):D756-63.
(3)
Ayam PJ dkk. Bioinformatika (2009)
(4)
Cokelaer dkk, Bioinformatika (2013)
Bahasa Pemrograman
Ular sanca
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/unipyrange/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
