Ini adalah aplikasi Linux bernama WellMeth yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai wellmeth-1.0.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama WellMeth dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
YahMeth
Ad
DESKRIPSI
WellMeth adalah kerangka kerja terintegrasi untuk analisis Reduced Representation Bisulfite-Seq
Fitur
- Memperluas pendekatan Genotyping by Sequencing (GBS) untuk mendeteksi sitosin termetilasi dalam DNA genom
- Bergantung pada ketersediaan genom referensi berkualitas tinggi dan untuk konstruksi perpustakaan, direkomendasikan untuk mencerna restriksi ganda dengan dua enzim yang tidak sensitif terhadap metilasi.
- Untuk pengurutan baca pendek akhir berpasangan, adaptor maju dan mundur asimetris akan diterapkan dengan kode batang panjang 4 hingga 6 nt dan sejumlah nukleotida acak (Unique Molecular Identifiers, UMIs) yang berdekatan dengan kode batang.
- Informasi UMI akan digunakan untuk identifikasi duplikat PCR pasca-penyelarasan
- Terdiri dari empat modul overlay: Preprocessing, Mapping, Deteksi varian Metilasi dan Metilasi Diferensial
- Modul saling berhubungan dengan skrip pembungkus yang dapat disesuaikan yang memungkinkan eksekusi sepenuhnya otomatis
- Cepat, akurat dan ringan
User interface
Konsol/Terminal
KATEGORI
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/wellmeth/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
