Questo è il comando arden-analyze che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
arden-analyze: analizza i risultati della mappatura del genoma di riferimento artificiale
SINOSSI
arden-analizzare [Opzioni] [INGRESSO RISORSE] [CUSTODIA DI USCITA]...
DESCRIZIONE
Script per analizzare i risultati della mappatura del genoma di riferimento artificiale. Questa sceneggiatura
identifica i presunti TP/FP su un set di dati specifico (letture).
VERSIONI
CUSTODIA DI USCITA
percorso della cartella di destinazione dell'output.
INGRESSO RISORSE
ppath al file ini. Per ottenere il formato richiesto dai un'occhiata ai file di esempio.
--versione
mostra il numero di versione del programma ed esci
-h, --Aiuto
mostra questo messaggio di aiuto ed esci
-p PHRED, --phred=PHRED
Specificare la codifica PHRED delle letture di input, ad esempio Illumina 1.3+ = -p 33.[predefinito:
33]
-r RANGO, --classifica interna=RANGO
Utilizza la classifica interna per le letture (necessaria se i nomi delle letture non possono essere
essere ordinati lessicograficamente allo stesso modo in Python e nel tuo sistema operativo da sam
strumenti).[predefinito:1]
Utilizza arden-analyze online utilizzando i servizi onworks.net