cmtk-dwi_mask_bad_slices - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

dwi_mask_bad_slices: trova sezioni difettose in un set di immagini ponderate in diffusione.

SINOSSI

dwi_mask_bad_slices DiffusioneImagePaths

DESCRIZIONE

Questo strumento legge una serie di immagini RM pesate in diffusione 3D e trova sezioni difettose. Una brutta fetta
in un'immagine di diffusione viene rilevata quella la cui intensità media è al di fuori di un valore specificato
intervallo attorno alla media delle medie di tutte le fette corrispondenti delle restanti
immagini di diffusione.

VERSIONI

globali Kit di strumenti Opzioni (questi sono condiviso by contro tutti i CMTK utensili)
--Aiuto
Scrivere l'elenco delle opzioni di base della riga di comando nell'output standard.

--aiuto-tutti
Scrivere l'elenco completo delle opzioni della riga di comando di base e avanzate nell'output standard.

--wiki
Scrivi l'elenco delle opzioni della riga di comando nell'output standard nel markup di MediaWiki.

--uomo
Scrivi il sorgente della pagina man nel markup 'nroff' sullo standard output.

--versione
Scrivi la versione del toolkit nell'output standard.

--eco
Scrive la riga di comando corrente nell'output standard.

--livello-verboso
Imposta il livello di verbosità.

--verboso, -v
Incrementa il livello di verbosità di 1 (deprecato; supportato per compatibilità con le versioni precedenti).

--thread
Imposta il numero massimo di thread paralleli (per thread POSIX e OpenMP).

Ingresso Opzioni
--b0count
Numero di immagini b=0 all'inizio dell'elenco delle immagini. Questi non sono inclusi
il rilevamento o il mascheramento di porzioni errate, ma vengono anche scritti nella directory di output per
convenienza. Si presuppone che tutte le immagini b=0 siano all'inizio dell'elenco di
inserire le immagini, ma non alla fine o al centro. [Predefinito: 0]

--orientamento-fetta
Definire l'orientamento delle sezioni delle immagini di diffusione. Valori supportati: "assiale",
"sagittale", "coronale", "slice-x", "slice-y", "slice-z", dove il valore predefinito è "assiale",
oppure utilizzare uno dei seguenti:

--assiale
Fette assiali [Questo is , il predefinito]

--sagittale
Fette sagittali

--coronale
Fette coronali

--fetta-x
L'asse delle coordinate X è la direzione della sezione

--fetta-y
L'asse delle coordinate Y è la direzione della sezione

--fetta-z
L'asse delle coordinate Z è la direzione della sezione [Questo is , il predefinito]

Vasca Taglia rivelazione
--stdev
Soglia per l'identificazione della fetta difettosa in unità di intensità deviazioni standard oltre
tutte le sezioni corrispondenti dalle restanti immagini di diffusione. [Predefinito: 3]

Uscita Opzioni
--convertire in
Tipo di dati scalare per le immagini di output. Se il tuo valore di riempimento è negativo ma your
inserisci dati senza segno, ad esempio, assicurati di selezionare un tipo di dati firmati per
produzione. Per impostazione predefinita, il tipo di dati di output è lo stesso del tipo di input. Supportato
valori: "char", "byte", "short", "ushort", "int", "uint", "float", "double" o use
uno dei seguenti:

--char
8 bit, firmato

--byte
8 bit, senza segno

--breve
16 bit, firmato

--ubreve
16 bit, senza segno

--int
32 bit firmati

--uint
32 bit senza segno

--galleggiante
32 bit in virgola mobile

--Doppio
64 bit in virgola mobile

--valore di riempimento , -p
Valore di riempimento per sostituire i dati delle sezioni difettose rilevate nelle immagini di output. [Predefinito: -uno]

--cartella di destinazione , -o
Percorso del file system per scrivere immagini con sezioni errate mascherate (ovvero, riempite con a
valore di riempimento). [Predefinito: NESSUNO]

AUTORI

Torsten Rohlfing, con contributi di Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff e Yaroslav Halchenko

Utilizza cmtk-dwi_mask_bad_slices online utilizzando i servizi onworks.net