Questo è il comando ecofind che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
ecofind - ricerca tassonomica e rank e id tassonomia per una data espressione regolare
modelli
DESCRIZIONE
ecoPCR è un software PCR elettronico sviluppato da LECA e Helix-Project. aiuta a
stimare la qualità dei primer per codici a barre.
Questo programma appartiene al pacchetto exoPCR.
SINOSSI
ecoscoperta [opzioni]
VERSIONI
-a : [A]ll abiliterà la ricerca su tutti i nomi alternativi e non solo sui nomi scientifici.
-d : [D]database contenente la tassonomia.
Per corrispondere al formato previsto, il database deve essere prima formattato dal
programma ecoPCRFormat.py che si trova nella directory degli strumenti. Scrivi il radicale del database
senza alcuna estensione.
-h : [H]elp - stampa aiuto
-l : [L] elenca tutti i ranghi tassonomici disponibili per -r opzione
-P : [P]ath: aggiungi una colonna contenente il percorso completo per ogni taxon visualizzato
-p : [P]arenti: specificando questa opzione vengono visualizzate tutte le informazioni dell'albero dei genitori per il
dato taxid.
-r : [R]estrict a dato rango tassonomico
-s : [S]ons: specificando questa opzione vengono visualizzate tutte le informazioni del sottoalbero per il dato
tassato.
-P : Visualizza [P]ath tassonomico come colonna supplementare nell'output
argomenti:
modello di nome contenente espressioni regolari
Usa ecofind online utilizzando i servizi onworks.net
