Questo è il comando ecogrep che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
ecogrep - filtraggio dei risultati dell'ecoPCR in base al filtro id tassonomico e all'espressione regolare
modello
SINOSSI
ecogrep [opzioni] Nome del file
DESCRIZIONE
ecoPCR è un software PCR elettronico sviluppato da LECA e Helix-Project. aiuta a
stimare la qualità dei primer per codici a barre.
Questo programma appartiene al pacchetto exoPCR.
VERSIONI
-1 : [PRIMO] : confronta il modello dato con l'oligonucleotide a filamento diretto
-2 : [SECONDO] : confronta il modello dato con l'oligonucleotide a filamento inverso
-d : [D]database contenente informazioni tassonomiche
-e : [E]rrors : errore massimo consentito nella corrispondenza del modello (opzione-1, -2 ed -p) (0 per
predefinito)
-p : [P]attern : schema oligonucleotidico
-h : [H]elp : stampa aiuto
-i : [I]ignoro il sottoalbero sotto un dato ID tassonomico
-r : [R] limita la ricerca al sottoalbero sotto un dato ID tassomico
-v : in[V]ert il senso di corrispondenza, per selezionare le linee non corrispondenti.
argomento:
nome del file di output ecoPCR
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