Questo è il comando fastaq-to_perfect_reads che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
fastaq_to_perfect_reads - Crea letture abbinate perfette dal riferimento
DESCRIZIONE
utilizzo: fastaq_to_perfect_reads [opzioni]
deviazione>
Crea letture fastq end accoppiate perfette da un file di sequenza, con dimensioni degli inserti campionate da
una distribuzione normale. L'orientamento alla lettura è innies. L'output è un file FASTQ interlacciato.
posizionale argomenti:
infile Nome del file di input
file di uscita
Nome del file di output
dimensione media dell'inserto
Dimensione media dell'inserto delle coppie di lettura
inserisci la deviazione standard
Deviazione standard della dimensione dell'inserto
copertura media
Copertura media delle letture
leggi la lunghezza
Lunghezza di ogni lettura
opzionale argomenti:
-h, --Aiuto
mostra questo messaggio di aiuto ed esci
--frammenti NOME DEL FILE
Scrivi sequenze FASTA di frammenti (cioè leggi coppie più sequenze tra di loro)
al nome file dato
--non Non consentire N o n caratteri nelle letture
--seme INT
Seme per generatore di numeri casuali. L'impostazione predefinita è utilizzare l'impostazione predefinita di Python
Usa fastaq-to_perfect_reads online utilizzando i servizi onworks.net
