Questo è il comando genome-music-plot-mutation-relationp che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
genoma music plot mutazione-relazione - Crea grafici per i risultati della mutazione-relazione
VERSIONE
Questo documento descrive la relazione tra mutazione e mutazione della trama musicale del genoma versione 0.04 (2016/01/01 at
23:10:18)
SINOSSI
genoma musica trama mutazione-relazione --input-matrix=? --output-pdf=?
[--skip-zero-mut-samples] [--genes-to-plot=?] [-plot-genes-in-order-listed]
OBBLIGATORIO ARGOMENTI
matrice-input Corda
Una matrice gene/campione generata dallo strumento di mutazione-relazione
output-pdf Corda
Un file pdf di output su cui disegnare la trama
OPTIONAL ARGOMENTI
salta-zero-mut-campioni Booleano
Non tracciare campioni che non hanno mutazioni su alcun gene da tracciare
Valore predefinito 'true' se non specificato
noskip-zero-mut-campioni Booleano
Rendi "falsi" i campioni skip-zero-mut
geni-to-plot Corda
Elenco separato da virgole di geni da tracciare (esempio: DNMT3A,NPM1)
trama-geni-in-ordine-elencati Booleano
Traccia i geni nell'ordine in cui sono elencati. L'impostazione predefinita è tracciarli in decrescente
ordine per numero di mutazioni
Valore predefinito 'false' (--noplot-genes-in-order-listed) se non specificato
noplot-geni-in-order-listed Booleano
Rendi 'falso' l'elenco dei geni della trama nell'ordine
DESCRIZIONE
Data una matrice generata usando "music mutazione-relazione --mutation-matrix-file", questo strumento
genererà una trama che evidenzi l'esclusività reciproca o la concorrenza tra i
stato di mutazione di un insieme predefinito di geni.
Usa genome-music-plot-mutation-relationp online usando i servizi onworks.net