Questo è il comando gmod_fasta2gff3.plp che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
$O - Converti FASTA in semplice GFF3
SINOSSI
% $O [opzioni]
RIGA DI COMANDO VERSIONI
--fasta_dir La directory contiene file fasta
(predefinito: ./fast)
--gfffilename Nome del file GFF3 da creare
(predefinito: ./out.gff)
--digitare SO tipo da assegnare a ciascuna caratteristica
(predefinito: EST)
--source Testo da visualizzare nella colonna sorgente
(predefinito: .)
--attributes Tag aggiuntivo=coppie di valori da visualizzare nella colonna 9
--nosequence Sopprime la sezione ##FASTA (cioè non farlo
stampare sequenze di DNA)
DESCRIZIONE
Questo script prende semplicemente una raccolta di file fasta e li converte in semplice GFF3
adatto per il caricamento in chado.
AUTORI
Scott Caino[email protected]>
Copyright (c) 2006
Questa libreria è un software gratuito; puoi ridistribuirlo e/o modificarlo sotto lo stesso
termini come Perl stesso.
Usa gmod_fasta2gff3.plp online utilizzando i servizi onworks.net