Questo è il comando gt-gff3validator che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
gt-gff3validator - Convalida rigorosamente i file GFF3 dati.
SINOSSI
gt validatore gff3 [opzione ...] [file_GFF3 ...]
DESCRIZIONE
-tipo di controllo [stringa]
utilizzare un'ontologia fornita in un file OBO per convalidare le relazioni genitore-figlio. se no
viene fornito l'argomento, viene utilizzato il file sofa.obo dalla directory gtdata/obo_files. Se
viene fornito un argomento, viene utilizzato come nome file OBO. Nel caso in cui tale file non
non esiste .obo viene aggiunto all'argomento e caricando il nome del file risultante da
viene tentata la directory gtdata/obo_files. (predefinito: non definito)
-xrfcheck [stringa]
controlla gli attributi Dbxref e Ontology_term per la sintassi corretta secondo a
file di definizione dell'abbreviazione. Se non viene fornito alcun argomento, il file GO.xrf_abbs dal
Viene utilizzata la directory gtdata/xrf_abbr. Se viene fornito un argomento, viene utilizzato come specifico
nome file per un file di abbreviazione. Nel caso in cui tale file non esista,
.xrf_abbr viene aggiunto all'argomento e caricando il nome del file risultante da
viene tentata la directory gtdata/xrf_abbr. (predefinito: non definito)
-Aiuto
visualizza la guida ed esci
-versione
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REPORTING BUG
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