Questo è il comando gt-seq che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
gt-seq - Analizza i file di sequenza dati e costruisce i file di indice corrispondenti.
SINOSSI
gt ss [opzione ...] file_sequenza [...]
DESCRIZIONE
-ricreare [si|no]
ricrea i file di indice, anche se esistono già (predefinito: no)
-spettacolo [si|no]
mostra tutte le sequenze (in formato FASTA) (default: no)
-showseqnum [APPREZZIAMO]
mostra la sequenza con il numero dato (in formato FASTA) (predefinito: non definito)
-gc-contenuto [si|no]
stampa contenuto GC (per file DNA) (impostazione predefinita: no)
-statistica [si|no]
mostra le statistiche della sequenza (predefinito: no)
-seqlengthdistri [si|no]
mostra la distribuzione della lunghezza della sequenza (predefinito: no)
-larghezza [APPREZZIAMO]
imposta la larghezza di output per la stampa in sequenza FASTA (0 disabilita la formattazione) (default: 0)
-o [Nome del file]
reindirizza l'output al file specificato (predefinito: non definito)
-gzip [si|no]
scrivi file di output compresso gzip (predefinito: no)
-bzip2 [si|no]
scrivere file di output compresso bzip2 (impostazione predefinita: no)
-vigore [si|no]
forza la scrittura nel file di output (impostazione predefinita: no)
-Aiuto
visualizza la guida ed esci
-versione
visualizza le informazioni sulla versione ed esci
REPORTING BUG
Segnala bug a[email protected]>.
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