Questo è il comando gt-stat che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
gt-stat - Mostra le statistiche sulle funzionalità contenute nei file GFF3.
SINOSSI
gt stat [opzione ...] [file_GFF3 ...]
DESCRIZIONE
-genelengthdistri [si|no]
mostra la distribuzione della lunghezza del gene (predefinito: no)
-genescoredistri [si|no]
mostra la distribuzione del punteggio genetico (predefinito: no)
-distribuzione della lunghezza dell'esone [si|no]
mostra la distribuzione della lunghezza dell'esone (predefinito: no)
-esonenumerodistri [si|no]
mostra la distribuzione del numero di esone (predefinito: no)
-distribuzione della lunghezza dell'introne [si|no]
mostra la distribuzione della lunghezza degli introni (default: no)
-cdslengthdistri [si|no]
mostra la distribuzione della lunghezza del CDS (misurata in amminoacidi) (default: no)
-fonte [si|no]
mostra il set di tag sorgente utilizzati (colonna 2 nelle normali righe GFF3) (impostazione predefinita: no)
-addintroni [si|no]
aggiungi le caratteristiche degli introni tra le caratteristiche degli esoni esistenti (prima di calcolare le statistiche) (predefinito:
No)
-v [si|no]
essere prolisso (predefinito: no)
-o [Nome del file]
reindirizza l'output al file specificato (predefinito: non definito)
-gzip [si|no]
scrivi file di output compresso gzip (predefinito: no)
-bzip2 [si|no]
scrivere file di output compresso bzip2 (impostazione predefinita: no)
-vigore [si|no]
forza la scrittura nel file di output (impostazione predefinita: no)
-Aiuto
visualizza la guida ed esci
-versione
visualizza le informazioni sulla versione ed esci
REPORTING BUG
Segnala bug a[email protected]>.
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