h5math - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

h5math - combina/crea file HDF5 con espressioni matematiche

SINOSSI

h5 matematica [OPZIONE] ... OUTPUT-HDF5FILE [INGRESSO-HDF5FILE...]

DESCRIZIONE

h5math accetta un numero qualsiasi di file HDF5 come input, insieme a un'espressione matematica e
li combina per produrre un nuovo file HDF5.

HDF5 è un formato binario gratuito e portatile e una libreria di supporto sviluppata dal National
Centro per le applicazioni di supercalcolo presso l'Università dell'Illinois a Urbana-Champaign.
Un singolo h5 il file può contenere più set di dati; per impostazione predefinita, h5 matematica crea un set di dati
chiamato "h5math", ma questo può essere modificato tramite il -d opzione, o usando la sintassi
FILE HDF5:SET DI DATI. -a l'opzione può essere utilizzata per aggiungere nuovi set di dati a un HDF5 esistente
file. La stessa sintassi viene utilizzata per specificare il set di dati utilizzato nei file di input; di
impostazione predefinita, viene utilizzato il primo set di dati (in ordine alfabetico).

Un semplice esempio di utilizzo di h5math è:

h5math -e "d1 + 2*d2" out.h5 foo.h5 bar.h5:blah

che produce un nuovo file, out.h5, aggiungendo il primo set di dati in foo.h5 con il doppio di
set di dati "blah" in bar.h5. Nell'espressione (specificata da -e), il primo set di dati di input
(da sinistra a destra) è indicato come d1, il secondo come d2, E così via.

Oltre ai set di dati di input, puoi anche utilizzare le coordinate x/y/z di ciascun punto nel
espressione, referenziata dalle variabili "x" "y" e "z" (per le prime tre dimensioni) come
così come una variabile "t" che si riferisce all'ultima dimensione. Per impostazione predefinita, questi sono numeri interi
a partire da 0 nell'angolo del set di dati, ma il -0 l'opzione cambierà l'origine x/y/z
al centro del set di dati (t non è influenzato), e il -r res opzione specificherà il
"risoluzione", dividendo le coordinate x/y/z per res.

Tutti i set di dati di input devono avere le stesse dimensioni, che sono anche le dimensioni di
Il risultato. Se non ci sono file di input e stai definendo l'output esclusivamente da a
formula matematica, è possibile specificare le dimensioni dell'output in modo esplicito tramite il -n
Taglia opzione, dove Taglia è ad esempio "2x2x2".

A volte, tuttavia, si desidera utilizzare solo una "fetta" di dimensioni più piccole di multi-
dati dimensionali. Per fare ciò, specifichi le coordinate in una (o più) sezioni
dimensione(e), tramite il -xyzt opzioni.

VERSIONI

-h Visualizza la guida sulle opzioni e sull'utilizzo della riga di comando.

-V Stampa il numero di versione e le informazioni sul copyright per h5math.

-v Output dettagliato.

-a Se il file di output HDF5 esiste già, aggiungi i dati come un nuovo set di dati piuttosto
piuttosto che sovrascrivere il file (il comportamento predefinito). Un set di dati esistente dello stesso
il nome all'interno del file viene tuttavia sovrascritto.

-e espressione
Specificare l'espressione matematica utilizzata per costruire l'output (generalmente
tra "virgolette per raggruppare l'espressione come un elemento nella shell), in termini di
variabili per i set di dati di input e le coordinate come descritto sopra.

Le espressioni usano una notazione infissa simile al C, con la maggior parte degli operatori standard e
funzioni matematiche (+, sin, ecc.) supportate. Questa funzionalità è
fornito (e le sue caratteristiche determinate) da GNU libmatheval.

-f Nome del file
Nome di un file di testo da cui leggere l'espressione, se no -e l'espressione è specificata.
Il valore predefinito è stdin.

-x ix, -y iy, -z iz, -t it
Questo dice h5 matematica per utilizzare una particolare porzione di un set di dati multidimensionale. per esempio
-x usa il sottoinsieme (con una dimensione in meno) con un indice x di ix (dove gli indici
va da zero a uno in meno dell'indice massimo in quella direzione). Qui, x/y/z
corrispondono alla prima/seconda/terza dimensione del set di dati HDF5. Il -t opzione
specifica una fetta nell'ultima dimensione, qualunque essa sia. Vedi anche il -0
opzione per spostare l'origine delle coordinate della sezione x/y/z al centro del set di dati.

-0 Sposta l'origine delle coordinate della sezione x/y/z al centro del set di dati, in modo che, ad es
-0 -x 0 (o più compatto -0x0) restituisce invece il piano x centrale del set di dati
del bordo x piano. (-t le coordinate non sono interessate.)

Questo sposta anche l'origine delle variabili x/y/z nell'espressione in modo che 0 sia
il centro del set di dati.

-r res Usa una risoluzione res per x/y/z (ma non t) variabili nell'espressione, in modo che
le coordinate della "griglia" dei dati sono divise per res. Il predefinito res è 1.

Ad esempio, se la dimensione x ha 21 passi della griglia, impostando a res di 20 significherà
che x variabili nell'espressione vanno da 0.0 a 1.0 (o da -0.5 a 0.5 se -0 is
specificato), anziché da 0 a 20.

-r non influisce sulle coordinate utilizzate per le sezioni, che sono sempre intere.

-n Taglia
Il set di dati di output deve avere le stesse dimensioni dei set di dati di input. Se non ci sono
set di dati di input (se stai definendo l'output esclusivamente con una formula), allora devi
specificare manualmente la dimensione dell'output con questa opzione: Taglia è della forma MxNxLx...
(con M, N, L essendo interi) e può essere di qualsiasi dimensionalità.

-d Nome
Scrivi nel set di dati Nome in uscita; in caso contrario, il set di dati di output è chiamato "dati"
per impostazione predefinita. Usa anche il set di dati Nome nell'ingresso; in caso contrario, il primo set di dati di input
(in ordine alfabetico) in un file. In alternativa, usa la sintassi FILE HDF5:SET DI DATI
(che sovrascrive -d opzione).

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