Questo è il comando kmc_tools-kmers_subtract che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre numerose workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, l'emulatore online di Windows o l'emulatore online di MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
kmc_tools-kmers_subtract - calcola la sottrazione di due database KMC
SINOSSI
kmc_tools kmers_sottrarre <output
[parametri_output]>
DESCRIZIONE
Il database di output conterrà solo i k-meri presenti nel primo set di input ma
assente nel secondo. Il valore del contatore è uguale al valore del primo input
impostato.
VERSIONI
Per ogni ingresso ci sono parametri aggiuntivi:
-ci
escludere k-mer che si verificano meno di volte
-cx
escludere k-mer che si verificano più di volte
Per l'output ci sono parametri aggiuntivi:
-ci
escludere k-mer che si verificano meno di volte
-cx
escludere k-mer che si verificano più di volte
-cs
valore massimo di un contatore
ESEMPIO
kmc -k28 file1.fastq kmers1 tmp
kmc -k28 file2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools kmers_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_subtract -cs200
Utilizzare kmc_tools-kmers_subtract online utilizzando i servizi onworks.net
