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kmc_tools-kmers_subtract - Online nel cloud

Esegui kmc_tools-kmers_subtract nel provider di hosting gratuito OnWorks su Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online di Windows o emulatore online di MAC OS

Questo è il comando kmc_tools-kmers_subtract che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre numerose workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, l'emulatore online di Windows o l'emulatore online di MAC OS

PROGRAMMA:

NOME


kmc_tools-kmers_subtract - calcola la sottrazione di due database KMC

SINOSSI


kmc_tools kmers_sottrarre <output
[parametri_output]>

DESCRIZIONE


Il database di output conterrà solo i k-meri presenti nel primo set di input ma
assente nel secondo. Il valore del contatore è uguale al valore del primo input
impostato.

VERSIONI


Per ogni ingresso ci sono parametri aggiuntivi:

-ci
escludere k-mer che si verificano meno di volte

-cx
escludere k-mer che si verificano più di volte

Per l'output ci sono parametri aggiuntivi:

-ci
escludere k-mer che si verificano meno di volte

-cx
escludere k-mer che si verificano più di volte

-cs
valore massimo di un contatore

ESEMPIO


kmc -k28 file1.fastq kmers1 tmp
kmc -k28 file2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools kmers_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_subtract -cs200

Utilizzare kmc_tools-kmers_subtract online utilizzando i servizi onworks.net


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