Questo è il comando kmc_tools-sort che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
kmc_tools-sort - ordina i database KMC
SINOSSI
kmc_tools sorta [parametri_input] [parametri_output]
DESCRIZIONE
Converte il database prodotto da KMC2.x nel formato database KMC1.x (che contiene k-mers in
ordine ordinato)
VERSIONI
Per ogni ingresso ci sono parametri aggiuntivi:
-ci
escludere k-mer che si verificano meno di volte
-cx
escludere k-mer che si verificano più di volte
Per l'output ci sono parametri aggiuntivi:
-cs
valore massimo di un contatore
ESEMPIO
kmc_tools ordina wy_kmc2 -ci3 -cx1000 wy_kmc1 -cs255
Usa kmc_tools-sort online utilizzando i servizi onworks.net
