Questo è il comando mapMers che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
mapMers - riporta le statistiche della mappatura dei kmer alle sequenze
SINOSSI
mappaMers {-statistiche|-regioni|-dettagli} -m Mersize -mer mers -seq veloce
VERSIONI
-statistiche riporta la media, il minimo e il massimo per ogni sequenza, insieme a un log2
istogramma dei conteggi
-regioni
segnala le regioni con copertura kmer
-dettagli
riporta il conteggio avanti e indietro nel database per ogni kmer nella sequenza
-m Mersize
-mer mers
, il meryl(1) banca dati
-seq veloce
file di sequenza di input
Usa mapMers online utilizzando i servizi onworks.net