med2ris - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

med2ris - converte i dati bibliografici Medline/Pubmed nel formato RIS

SINOSSI

med2ris [-es log] [-F da-codifica] [-h] [-i] [-l loglevel] [-L file di log] [-O filetto]
[-O filetto] [-q] [-t a-codifica] [-T Digitare] [-y sentiero]

DESCRIZIONE

med2ris converte i dati di riferimento Pubmed in dati RIS. Il convertitore comprende sia il
taggato formato Pubmed (che assomiglia superficialmente a RIS) e il formato XML secondo
, il PubMedArticolo DTD[1]. Nella maggior parte dei casi med2ris è in grado di rilevare automaticamente l'input
tipo di dati.

VERSIONI

-e log-destinazione
log-destination può avere i valori 0, 1 o 2 o le stringhe equivalenti stderr,
syslog, o filetto, rispettivamente. Questo valore specifica dove vanno le informazioni di registro.
0 (zero) significa che i messaggi vengono inviati a stderr. Sono subito disponibili sul
schermo ma possono interferire con l'output del comando. 1 invierà l'output al
impianto syslog. Tieni presente che syslog deve essere configurato per accettare i messaggi di registro
dai programmi utente, vedere il syslog(8) pagina man per ulteriori informazioni. Unix-like
i sistemi di solito salvano questi messaggi in /var/log/user.log. 2 invierà i messaggi a
un file di registro personalizzato che può essere specificato con il -L opzione.

-f da-codifica
Seleziona la codifica dei caratteri di input. Le codifiche supportate dipendono dalla piattaforma e
di solito si trova in iconv_open(3). Se non vengono specificate codifiche, ISO-8859-1 aka
Si presume latino-1.

-h
Visualizza la guida e la schermata di utilizzo, quindi esce.

-i
Genera informazioni aggiuntive sui tag sconosciuti o non utilizzati. Principalmente utile per eseguire il debug del
conversione se il formato di input è cambiato.

-l a livello di registro
Specificare la priorità fino alla quale vengono registrati gli eventi. Questo è un numero compreso tra 0
e 7 o una delle stringhe emerg, allarme, crit, sbagliare, identificazione dei warning, bacheca, Maggiori informazioni., mettere a punto,
rispettivamente (vedi anche Definizioni del livello di log). -1 disabilita completamente la registrazione. un basso
livello di log come 0 significa che vengono registrati solo i messaggi più critici. Un registro più alto
livello significa che vengono registrati anche gli eventi meno critici. 7 includerà il debug
messaggi. Quest'ultimo può essere prolisso e abbondante, quindi vuoi evitare questo livello di registro
a meno che tu non abbia bisogno di rintracciare i problemi.

-L file di log
Specificare il percorso completo di un file di registro che riceverà i messaggi di registro. In genere questo
sarebbe /var/log/refdba.

-o filetto
Invia output a filetto. Se filetto esiste, il suo contenuto verrà sovrascritto.

-O filetto
Invia output a filetto. Se filetto esiste, l'output verrà aggiunto.

-q
Inizia senza leggere i file di configurazione. Il client utilizzerà il tempo di compilazione
i valori predefiniti per tutti i valori non impostati con le opzioni della riga di comando.

-t a-codifica
Seleziona la codifica dei caratteri di output. Le codifiche supportate dipendono dalla piattaforma e
di solito si trova in iconv_open(3). Se non vengono specificate codifiche, ISO-8859-1 aka
Si presume latino-1.

-T Digitare
Ignora il rilevamento automatico del tipo. Valori ammessi per Digitare sono "tag" e "xml"
rispettivamente per il formato Pubmed con tag e per il formato Pubmed XML.

-y confidare
Specificare la directory in cui si trovano i file di configurazione globali Nota: per impostazione predefinita, all
Le applicazioni RefDB cercano i loro file di configurazione in una directory specificata
durante la fase di configurazione durante la creazione del pacchetto. Cioè, non hai bisogno del -y
opzione a meno che non si utilizzino binari precompilati in posizioni insolite, ad esempio spostando a
pacchetto rpm.

CONFIGURAZIONE

med2ris valuta il file med2risrc per inizializzarsi.

Table 1. med2risrc
? ?
│Variabile │ Predefinito │ Commento │
? ?
│outfile │ (nessuno) │ Il file di output predefinito │
│ │ │ nome. ?
? ?
│outappend │ t │ Determina se │
│ │ l'output viene aggiunto (t)
│ │ │ in un file esistente o │
│ │ │ sovrascrive (f) un
│ │ │ file esistente. ?
? ?
non mappato │ t │ Se impostato su t, sconosciuto
│ │ │ tag nei dati di input │
│ │ │ verrà emesso dopo │
│ │ │ a etichetta; il
│ │ │ i dati risultanti possono essere │
│ │ │ ispezionato e poi
│ │ │ inviato tramite sete a
│ │ │ togliti questi │
│ │ │ linee aggiuntive. Se impostato
│ │ │ a f, i tag sconosciuti lo faranno │
│ │ │ essere ignorato con grazia. ?
? ?
│from_enc │ ISO-8859-1 │ La codifica dei caratteri │
│ │ │ dei dati di input │
? ?
│to_enc │ ISO-8859-1 │ La codifica dei caratteri │
│ │ │ dei dati in uscita │
? ?
│logfile │ /var/log/med2ris.log │ Il percorso completo di un │
│ │ │ file di registro personalizzato. Questo è │
│ │ │ utilizzato solo se logdest è │
│ │ │ impostato in modo appropriato. ?
? ?
│logdest │ 1 │ La destinazione del │
│ │ │ informazioni di registro. 0 =
│ │ │ stampa su stderr; 1 = usa │
│ │ │ la funzione syslog; 2 =
│ │ │ usa un file di registro personalizzato. ?
│ │ │ Quest'ultimo ha bisogno di un │
│ │ │ impostazione corretta di │
│ │ file di registro. ?
? ?
│loglevel │ 6 │ Il livello di log fino a │
│ │ │ quali messaggi saranno │
│ │ inviato. Un valore basso (0) │
│ │ │ permette solo il massimo │
│ │ │ messaggi importanti, un │
│ │ │ impostazione alta (7) consente │
│ │ │ tutti i messaggi incluso │
│ │ │ messaggi di debug. -1 significa
│ │ │ non verrà registrato nulla. ?
? ?

DATA TRATTAMENTO

Le parole chiave con più sottotitoli MeSH sono suddivise in più parole chiave con un MeSH
sottotitolo ciascuno. Ciò semplifica notevolmente la ricerca dei sottotitoli MeSH.

med2ris non convalida i file di input. Cioè, i file di input devono attenersi al
regole delle origini dati, altrimenti i risultati della conversione non sono prevedibili.

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