mincaverage - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

mincaverage - file minc medi

SINOSSI

mincaveraggio [ ] .mnc [ .mnc...] .mnc

DESCRIZIONE

Mincaverage fa la media dei file minc insieme. È consentita una serie di comportamenti facoltativi come
bene: volumi di pre-normalizzazione, creazione di un volume di deviazione standard, media di oltre a
dimensione specificata dei file di input.

VERSIONI

Nota che le opzioni possono essere specificate in forma abbreviata (purché siano uniche) e
può essere dato ovunque sulla riga di comando.

Generale Opzioni

-2 Crea un file di output in formato MINC 2.0.

-picchiatore
Sovrascrivi un file esistente.

-noclobber
Non sovrascrivere un file esistente (impostazione predefinita).

-verboso
Stampa le informazioni sullo stato di avanzamento per ogni blocco di dati copiato (impostazione predefinita).

-silenzioso Non stampare le informazioni sullo stato di avanzamento.

-debug Stampa informazioni aggiuntive (ad es. fattori di normalizzazione).

-elenco file Nome del file
Specificare un file contenente un elenco di nomi di file di input. Se viene dato "-", allora file
i nomi vengono letti da stdin. Se viene data questa opzione, non dovrebbe esserci alcun input
nomi di file specificati nella riga di comando. Le righe vuote nel file di input sono
ignorato.

-dimensione_max_buffer_in_kb dimensione buffer
Specificare la dimensione massima dei buffer interni (in kbyte). Il valore predefinito è 4096
kbyte.

Uscita Digitare Opzioni

Queste opzioni controllano la precisione di memorizzazione e la dimensione dei singoli valori voxel nel
file di uscita.

-tipo di file
Non eseguire alcuna conversione di tipo (impostazione predefinita).

-byte Scrivi valori interi a 8 bit.

-corto Scrivi valori interi a 16 bit.

-int Scrivi valori interi a 32 bit.

-lungo Sostituito da -int.

-galleggiante Scrivere valori in virgola mobile a precisione singola.

-raddoppiare
Scrivere valori in virgola mobile a precisione doppia.

-firmato Scrivi i valori come interi con segno (impostazione predefinita per short e long). Ignorato per
tipi in virgola mobile.

-non firmato
Scrivi i valori come interi senza segno (impostazione predefinita per byte). Ignorato per fluttuare
tipi di punti

-gamma verbale max
specifica l'intervallo valido di valori voxel di output nella loro rappresentazione intera.
L'impostazione predefinita è l'intervallo completo per il tipo e il segno. Questa opzione viene ignorata per
valori in virgola mobile. Affinché abbia effetto, è necessario specificare un tipo.

Una media di Opzioni

-normalizzare
Normalizza i volumi alla loro media globale prima di calcolarne la media (basata sulla media
di voxel con un valore superiore al 2% dell'intervallo completo al di sopra del minimo).

-non normalizzare
Non normalizzare i volumi (impostazione predefinita).

-sdfile sdfile.mnc
Specificare il nome di un file di deviazione standard di output, da calcolare in aggiunta
la media normalmente calcolata.

-pesofile pesofile.mnc
Specificare un file di peso voxel cumulativo di output (predefinito=nessuno).

-copia_intestazione
Copia tutte le informazioni aggiuntive dell'intestazione dal primo file di input (impostazione predefinita
per un file di input).

-nessuna intestazione_copia
Non copiare informazioni di intestazione aggiuntive (impostazione predefinita per molti file di input).

-media nome debole
Specifica il nome di una dimensione su cui dovremmo fare la media (o calcolare
deviazione standard). Se la normalizzazione viene eseguita, si applica ancora solo a separare
solo file - non viene eseguita alcuna normalizzazione all'interno di un file.

-binarizzare
Binarizzare i volumi di input prima di calcolare la media. La binarizzazione è fatta
specificando un intervallo di valori che contribuiscono con 1 alla media. Normalizzazione di
l'input non è consentito durante l'esecuzione della binarizzazione.

-binrange verbale max
Specificare l'intervallo di valori per la binarizzazione.

-binvalore APPREZZIAMO
Specificare un singolo valore legale (intero) per la binarizzazione. L'intervallo è impostato su +/-
0.5 intorno a questo valore per ottenere un arrotondamento efficace dei valori di input.

-ignora_sotto APPREZZIAMO
Non includere voxel al di sotto di questo valore nella media e sd

-ignora_sopra APPREZZIAMO
Non includere voxel al di sopra di questo valore nella media e sd

-pavimento APPREZZIAMO
Sinonimo di -ignora_sotto

-ignora_sopra APPREZZIAMO
Sinonimo di -ignora_sopra

-pesi
Specificare una serie di pesi per la media. Il numero di valori di ponderazione deve
corrispondere al numero di file di input e i valori devono essere forniti come un singolo
argomento con virgole o spazi come separatori. La somma dei pesi deve essere non
zero. Se vengono utilizzati pesi con una dimensione media, solo un file di input può
essere specificato.

-width_ponderato
Questa opzione può essere utilizzata solo quando si esegue la media su una dimensione (-media opzione). Esso
specifica che la ponderazione deve essere eseguita utilizzando la variabile di larghezza che corrisponde
alla dimensione media. Ad esempio, usando -width_ponderato con -media tempo
utilizzerà la variabile time-width per pesare i valori.

-min_peso APPREZZIAMO
Specifica il peso minimo (numero di volumi se non vengono specificati pesi)
necessario per calcolare una media valida. Se il peso cumulativo per un voxel è
al di sotto di questa soglia, la media e la sd segnalate saranno 0. Ciò normalmente sarebbe
essere utile se i valori vengono esclusi utilizzando uno dei -ignorare opzioni, o per valori NaN
nel/i volume/i di ingresso.

-min_peso_frazione APPREZZIAMO
Uguale a -min_peso, ma specificato come frazione della somma dei pesi di input
(o il numero di volumi in ingresso, se non viene specificato alcun peso).

Generico Opzioni per contro tutti i comandi:

-Aiuto Stampa il riepilogo delle opzioni della riga di comando ed esci.

-versione
Stampa il numero di versione del programma ed esci.

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