Questo è il comando stat-vs-stat.pl che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre numerose workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online di Windows o emulatore online di MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
stat-vs-stat.pl -- disegna grafici di 1 statistica rispetto a un'altra statistica
SINOSSI
cbtest.pl [ingresso1...]
VERSIONI
Il file di input dovrebbe essere un allineamento che ha come file .rocr (presumibilmente generato da
filter.pl --rocr). L'uscita è rappresentata graficamente a .cutoff.roc.png.
la sensibilità/specificità richiede un conteggio falso negativo, e come tale richiede un
.filterstats.
Altre opzioni:
--stat|predictor|x specifica quale statistica usare come predittore
--samples|n imposta il numero di campioni (il valore predefinito è il campione ad ogni possibile cutoff)
--maxsamples|maxn imposta un massimo per n/campioni
--clean forza un ricampionamento del file .rocr
--log può applicare la scala logaritmica agli assi x, y o xy
--fn può specificare un conteggio FN per il calcolo della sensibilità
--avg medie di precarico (normalmente trovate da filterstats)
(nota: le medie non estratte per impostazione predefinita, quindi specifica --avg (senza argomenti) su
abilitarli)
--noavg non traccia la linea per le medie
--lwd può specificare lo spessore della linea
--format può specificare il formato del file di output (png predefinito)
--pdf imposta il formato su pdf
--nofstats disabilita la ricerca delle statistiche filterstats
--nofn finge di non avere statistiche fn (es: salta la sensibilità)
--fstats specifica il file filterstats da usare
Utilizzare stat-vs-stat.pl online utilizzando i servizi onworks.net
