Questo è il comando xtractore che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
xtractore - estrae le sequenze corrispondenti alle caratteristiche annotate dalla sequenza data
filetto
SINOSSI
xtrattore [Opzioni] caratteristiche.gff3 sequenze.fasta
DESCRIZIONE
Opzioni:
-d|--debug
stampa dell'output di debug
-h|--aiuto
stampa questo messaggio di aiuto ed esci
-i|--idfile: FILE
file contenente un elenco di ID di funzionalità (1 per riga senza spazi); se fornito,
verranno estratte solo le feature con ID in questo file
-o|--file di uscita: FILE
file in cui verranno scritte le sequenze di output; l'impostazione predefinita è terminale (stdout)
-t|--tipo: STRING
tipo di caratteristica da estrarre; può essere utilizzato più volte per estrarre le funzionalità di più
Tipi di
-v|--versione
stampa il numero della versione ed esci
-V|--prolisso
stampa messaggi di avviso e di errore dettagliati
-w|--larghezza: INT
larghezza di ogni riga di sequenza nell'output Fasta; il valore predefinito è 80; impostato a 0 per no
formattazione
Usa xtractore online utilizzando i servizi onworks.net
