Questa è l'app Linux denominata ADOMA la cui ultima versione può essere scaricata come adoma-1.0.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata ADAMA con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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Adoma
DESCRIZIONE
ADOMA sta per: Visualizzazione alternativa di allineamento multiplo. ADOMA può creare quattro diverse visualizzazioni di un allineamento di sequenze multiple: un allineamento ClustalW in formato HTML, un allineamento ClustalW semplificato in formato HTML e/o txt e un allineamento ClustalW colorato in formato HTML. Per esempi di questi file di output, controlla gli screenshot. ADOMA utilizza ClustalW per creare l'allineamento multiplo da sequenze di DNA o proteine e le visualizza in modo leggermente diverso dal normale output di ClustalW. ADOMA è un programma a riga di comando che può essere facilmente utilizzato nelle pipeline.
Per maggiori informazioni controlla il README.md nella sezione File.
Come citare ADOMA:
Zaal, D. e Nota, B. (2016), ADOMA: uno strumento da riga di comando per modificare l'output di allineamento multiplo ClustalW. Mol. Inf., 35: 42-44. doi: 10.1002/minf.201500083
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/minf.201500083/abstract
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
Shell Unix, Python
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/adoma/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
