Questa è l'app Linux denominata BioEvent la cui ultima versione può essere scaricata come bioevent-v0.01-all.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata BioEvent con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
BioEvento
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DESCRIZIONE
Questo è un progetto basato su Java per l'estrazione di eventi complessi dal testo e la risoluzione di co-riferimento. Attualmente il codice può leggere il formato delle attività condivise BioNLP (http://2011.bionlp-st.org/) e i2b2 Natural Language Processing for Clinical Data shared task format (https://www.i2b2.org/NLP/DataSets/Main.php). L'estrazione degli eventi include la ricerca di eventi e dei parametri per un evento in un testo.
Il metodo è basato su SVM ma possono essere adottati altri algoritmi ML. I dettagli del metodo sono spiegati nel seguente documento:
Ehsan Emadzadeh, Azadeh Nikfarjam e Graciela Gonzalez. 2011. Apprendimento a doppio strato per l'estrazione di eventi biologici dal testo. In Proceedings of the BioNLP 2011 Workshop Companion Volume for Shared Task, Portland, Oregon, giugno. Associazione per la linguistica computazionale
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
Perl, Java
Ambiente database
JDB, MySQL
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/bioevent/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
