Questa è l'app Linux denominata CaptureProbe la cui ultima versione può essere scaricata come Runningexample.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata CaptureProbe con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
CaptureProbe
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DESCRIZIONE
Qui abbiamo sviluppato CaptureProbe, uno strumento Java intuitivo e grafico per la progettazione di sonde di acquisizione per applicazioni Capture Hi-C. CaptureProbe è facile da usare, richiede solo semplici file di input e fornisce numerosi parametri per la progettazione delle sonde. CaptureProbe può progettare sonde specificamente sia per i siti genomici che per le regioni genomiche di interesse. I confronti con i software esistenti (HiCapTools e GOPHER) hanno indicato che CaptureProbe ha un buon rapporto di successo di progettazione e una migliore specificità della sonda.
Citazione: MA YF, ADEOLA AC, SUN YB, et al. 2020. CaptureProbe: uno strumento java per la progettazione di sonde per applicazioni di acquisizione Hi-C. Zool Res [J], 41: 94-96.
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/captureprobe/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
