Questa è l'app Linux denominata datasw la cui ultima versione può essere scaricata come datasw-win64.exe. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata datasw con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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datasw
DESCRIZIONE
Lo scattering di raggi X a piccolo angolo (SAXS) in soluzione è un metodo comune a bassa risoluzione che può integrare in modo efficiente le informazioni ad alta risoluzione ottenute mediante cristallografia o NMR. La monodispersità del campione è la chiave per un'interpretazione affidabile dei dati SAXS e per la creazione di modelli. Le configurazioni della linea di fascio con cromatografia liquida ad alte prestazioni (HPLC) in linea sono particolarmente utili per la profilazione accurata di campioni eterogenei. Il programma DATASW esegue la media dei singoli frame di dati dall'esperimento HPLC-SAXS utilizzando una finestra scorrevole di una dimensione specificata dall'utente, calcola i parametri complessivi (I(0), Rg, Dmax e MW) e prevede lo stato di piegatura (piegato/spiegato) del campione. Le applicazioni di DATASW sono illustrate per diverse proteine con vari comportamenti di oligomerizzazione registrati a diverse linee di luce.
Se utilizzi DATASW nel tuo lavoro, per favore, cita:
Shkumatov AV & Strelkov SV (2015) Acta Cryst. D71, 1347–1350
Caratteristiche
- sottrazione del buffer
- media dei fotogrammi utilizzando una finestra scorrevole di dimensioni specificate dall'utente
- calcolo di Rg, I0, Dmax utilizzando l'approssimazione di Guinier o la trasformata di Fourier indiretta
- stima del peso molecolare mediante volume di Porod, volume di correlazione e SAXS MoW
- rilevamento dei picchi
- tracciare i risultati in modo interattivo con i limiti di diversi assi
- diagramma Kratky adimensionale per il campione e due proteine di riferimento (BSA e hTau40wt non ripiegato)
- media interattiva di frame di dati e normalizzazione del diagramma di Kratky adimensionale
Pubblico
Scienza/Ricerca, Istruzione
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
Perl
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/datasw/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
