Questa è l'app Linux denominata DeNovoCheck la cui ultima versione può essere scaricata come DeNovoCheck_270113.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata DeNovoCheck con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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DeNovo Check
DESCRIZIONE
DeNovoCheck deve essere utilizzato per l'analisi dell'ereditarietà nei dati NGS tio. Per le malattie mendeliane dominanti rare, i trii paziente-genitore vengono spesso utilizzati per ridurre il numero di varianti candidate. L'algoritmo basa la previsione dell'ereditarietà sui dati disponibili nei file BAM parentali e consente una selezione rapida e affidabile di potenziali varianti de novo.
Caratteristiche
- Identificare le varianti de novo nei dati NGS trio
- Parametri della riga di comando
- Configurazione del file delle proprietà
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
Java
Categorie
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/denovocheck/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
