Questa è l'app Linux denominata Valutazione della frammentazione in silico la cui ultima versione può essere scaricata come input.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata Valutazione della frammentazione in silico con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
Ad
Valutazione della frammentazione in silico
DESCRIZIONE
Abbiamo confrontato le prestazioni di quattro strumenti di frammentazione in silico pubblicamente disponibili che aiutano nella delucidazione della struttura dei metaboliti (MetFrag, CFM-ID, MAGMa+ e MS-FINDER).
Utilizzando l'output di questi strumenti abbiamo sviluppato un modello di voto/consenso che combina, riordina e riclassifica il file dei candidati e aumenta la percentuale di successo corretta.
Abbiamo utilizzato 520 composti della sfida CASMI 2016 con 312 composti per l'addestramento e 208 composti per scopi di convalida.
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/in-silico-fragmentation/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.