Questa è l'app Linux denominata INTEGRATE la cui ultima versione può essere scaricata come INTEGRATE.0.2.6.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata INTEGRATE with OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
Ad
INTEGRARE
DESCRIZIONE
INTEGRARE: chiamare le fusioni geniche con giunzioni di fusione esatte e breakpoint genomici combinando i dati RNA-Seq e WGS.Per scaricare il codice sorgente, il manuale di riferimento e il test case, vai su "File".
Fare riferimento anche a "Wiki" per i dettagli.
Caratteristiche
- Alta sensibilità e specificità
- Giunti di fusione esatti e breakpoint genomici
- Algoritmo di mappatura a lettura divisa veloce basato sulla trasformata di Burrows-Wheeler
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/integrate-fusion/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.