Questa è l'app Linux denominata MaxBin2 la cui ultima versione può essere scaricata come MaxBin-2.2.7.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app chiamata MaxBin2 con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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MaxBin2
DESCRIZIONE
MaxBin2 è la nuova generazione di MaxBin (https://sourceforge.net/projects/maxbin/) che supporta più campioni contemporaneamente. MaxBin è un software per il raggruppamento di sequenze metagenomiche assemblate basato su un algoritmo di Expectation-Maximization. Gli utenti possono comprendere i bin sottostanti (genomi) dei microbi nei loro metagenomi semplicemente fornendo sequenze metagenomiche assemblate e le informazioni di copertura delle letture o le letture di sequenziamento. Per comodità degli utenti, MaxBin riporterà le statistiche relative al genoma, inclusa la completezza stimata, il contenuto GC e la dimensione del genoma nella pagina di riepilogo del raggruppamento. Gli utenti possono utilizzare MEGAN o un software simile sui contenitori MaxBin per scoprire la tassonomia di ciascun contenitore al termine del processo di raccolta.Ulteriori informazioni sono disponibili sul sito Web ufficiale di MaxBin: http://downloads.jbei.org/data/microbial_communities/MaxBin/MaxBin.html
Caratteristiche
- Binning metagenomica
Linguaggio di programmazione
C++
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/maxbin2/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
