Questa è l'app Linux denominata MDA, la cui ultima versione può essere scaricata come mdaGui.zip. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata MDA con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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MDA
DESCRIZIONE
MDA è un software di tracciamento 3D a singola particella che affronta esplicitamente gli esperimenti di microscopia a fluorescenza in profondità nei campioni viventi. È in grado di ridurre al minimo l'errore sistematico che si verifica con le tecniche 3D basate sull'astigmatismo a causa delle aberrazioni indotte dal disadattamento dell'indice di rifrazione. Contrariamente alle tecniche esistenti, il metodo determina l'aberrazione direttamente dal flusso di immagini 2D acquisite sfruttando il movimento intrinseco delle particelle e la ridondanza introdotta dall'astigmatismo. Non richiede ulteriore sforzo sperimentale per l'utente e l'imaging può essere avviato direttamente una volta che le regioni interessanti
nel campione sono stati identificati.
MDA è scritto in MATLAB e viene fornito con un'interfaccia utente grafica. La routine di adattamento delle particelle è fornita da una libreria esterna scritta in C.
I risultati possono essere esportati nel Matlab Workspace o le coordinate trackID, frameID e xyz vengono salvate in file.
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/mdagui/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.