Questa è l'app Linux denominata MuffinEC la cui ultima versione può essere scaricata come muffinec-2.0b.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata MuffinEC con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
Muffin EC
Ad
DESCRIZIONE
MuffinEC è un software di correzione degli errori in grado di gestire tutti i tipi di errori (cancellazioni di inserimento, mismatch e basi sconosciute). Supporta ufficialmente quattro tecnologie (Illumina, 454, ion Torrent e PacBio - sperimentale) e ha anche una configurazione generica per altre (vecchie e/o nuove). È rilasciato sotto LGPL versione 3.0. MuffinEC può utilizzare sistemi multicore, grazie alla sua implementazione OpenMP.
Stiamo sviluppando la seconda versione di MuffinEC. La versione beta è già disponibile online. Le modifiche sono elencate nel file VERSION_HISTORY. Si prega di segnalare qualsiasi problema riscontrato all'indirizzo e-mail specificato nel file README. Apprezziamo molto il vostro aiuto.
Caratteristiche
- Gestisce inserimenti, cancellazioni, mismatch, basi sconosciute
- Supporta Illumina, 454, Ion Torrent e PacBio (sperimentale)
- Parametro generico per altre tecnologie
- Multithread
- Basso consumo di memoria
Pubblico
Tecnologia dell'informazione, industria sanitaria, scienza/ricerca, utenti finali avanzati, sviluppatori, utenti finali/desktop
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
C++
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/muffinec/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
