Questa è l'app Linux denominata PINCIS la cui ultima versione può essere scaricata come PINCIS_v12.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata PINCIS con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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PINCI
DESCRIZIONE
PINCIS.pl (PIcs N-/C-terminal Inferred Substrates perl script) è un piccolo strumento a riga di comando per designare e analizzare i dati PICS (Schilling et al., Nat. Protocols, 2011) per ottenere il sito principale e non principale specificità delle proteasi. Pertanto, lo script filtra gli elenchi di peptidi forniti per i peptidi di libreria (generati dalla proteasi di digestione nel flusso di lavoro di proteomica anziché dalla proteasi di interesse) e stampa elenchi di estensioni della finestra di scissione del terminale N e C dedotte che possono essere utilizzate contemporaneamente per generare visualizzazioni di specificità di clivaggio come iceLogo (https://iomics.ugent.be/icelogoserver/create).
Caratteristiche
- Analisi dei dati PICS
- Determinazione della finestra di clivaggio
Pubblico
Altro pubblico
Linguaggio di programmazione
Perl
Categorie
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/pincis/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri Sistemi Operativi gratuiti.
