Questa è l'app Linux denominata VCF Explorer la cui ultima versione può essere scaricata come VCFExplorer-1.0-Setup.exe. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata VCF Explorer con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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Esploratore VCF
DESCRIZIONE
a tecnologie ad alto rendimento diminuendo il costo ha portato a una serie di progetti di sequenziamento costituiti da migliaia di interi genomi. Il cambio di paradigma dall'esoma all'intero genoma comporta un aumento significativo delle dimensioni dei file di output. La maggior parte degli strumenti esistenti sviluppati per analizzare i file dell'esoma non sono adeguati per i file VCF di grandi dimensioni prodotti da studi sull'intero genoma. In questo lavoro presentiamo VCF-Explorer, un software di analisi variante in grado di gestire file di grandi dimensioni. L'efficiente gestione della memoria del programma e l'eliminazione della fase di parsing preliminare consentono di effettuare l'analisi su normali computer. VCF-Explorer presenta un ambiente di facile utilizzo in cui è possibile definire vari tipi di query per l'annotazione e gli esempi. VCF-Explorer può essere eseguito su diversi ambienti e piattaforme computazionali che vanno da un laptop standard a un server avanzato.
Caratteristiche
- Un ambiente facile da usare
- Gestione efficiente della memoria
- Elaborazione di file VCF di grandi dimensioni (intero genoma)
- Operabile su personal computer con risorse computazionali limitate
Interfaccia utente
Qt
Linguaggio di programmazione
C++, C
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/vcfexplorer/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
