This is the Windows app named clusterProfiler whose latest release can be downloaded as clusterProfilersourcecode.tar.gz. It can be run online in the free hosting provider OnWorks for workstations.
Download and run online this app named clusterProfiler with OnWorks for free.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
IMMAGINI
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ClusterProfiler
DESCRIZIONE
clusterProfiler is an R/Bioconductor package that provides a unified workflow for functional enrichment analysis to interpret high-throughput omics results. It supports both over-representation analysis and gene set enrichment analysis, letting you work with unranked gene lists or ranked statistics from differential pipelines. The package connects to multiple knowledge bases—such as Gene Ontology, KEGG, Reactome, Disease Ontology, MeSH and others—through a consistent interface so you can query different biological lenses without rewriting code. It is designed for breadth, covering coding and non-coding features and thousands of organisms by leveraging continuously updated annotations. Results are returned in tidy, manipulation-friendly structures and pair naturally with rich visualization functions (via companion tooling) to summarize pathways, terms, and gene–set relationships.
Caratteristiche
- Unified ORA and GSEA workflows across multiple annotation sources
- Broad species support using up-to-date gene annotations
- Tidy outputs that integrate cleanly with downstream R data pipelines
- Built-in visualization of enrichment results through companion plotting tools
- Multi-group comparison utilities (e.g., compareCluster) for cross-condition analysis
- Detailed vignettes and manuals for reproducible, end-to-end enrichment studies
Linguaggio di programmazione
R
Categorie
This is an application that can also be fetched from https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/. It has been hosted in OnWorks in order to be run online in an easiest way from one of our free Operative Systems.
