Si tratta dell'app per Windows denominata COGsoft, eseguibile online su Windows tramite Linux. L'ultima versione può essere scaricata come COGsoft.04.19.2012.tgz. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata COGsoft per eseguirla su Windows online o su Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
COGsoft funzionerà online su Windows anziché su Linux
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DESCRIZIONE
Software per la realizzazione di Cluster di Gruppi Ortologhi (con il nuovo algoritmo EdgeSearch). Ultimo riferimento: Kristensen DM, Kannan L, Coleman MK, Wolf YI, Sorokin A, Koonin EV, Mushegian A. Bioinformatics 2010.Caratteristiche
- Una descrizione dei punti di forza/debolezza dei diversi metodi: Kristensen DM, Wolf YI, Mushegian AR, Koonin EV. Metodi computazionali per l'inferenza dell'ortologia genica. Breve bioinformazione. 2011 settembre;12(5):379-91. Epub 2011 giugno 19. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21690100
- Riferimento algoritmo: Kristensen DM, Kannan L, Coleman MK, Wolf YI, Sorokin A, Koonin EV, Mushegian A. Un algoritmo a basso polinomio per assemblare cluster di gruppi ortologhi da migliori corrispondenze simmetriche intergenomiche. Bioinformatica. 2010 giugno 15;26(12):1481-7. Epub 2010 2 maggio. http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/btq229?ijkey=zD7TIWnncGvDGYE&keytype=ref
- Recensione buona/approfondita di ortologhi/COG: Koonin EV. Ortologhi, paraloghi e genomica evolutiva. Annu Rev Genet. 2005;39:309-38. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16285863
- Documento originale COG: Tatusov RL, Koonin EV, Lipman DJ. Una prospettiva genomica sulle famiglie di proteine. Scienza. 1997 ottobre 24;278(5338):631-7. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9381173
- Banca dati COG: Tatusov RL, Galperin MY, Natale DA, Koonin EV. Il database COG: uno strumento per l'analisi su scala genomica delle funzioni e dell'evoluzione delle proteine. Acidi nucleici Res. 2000 gennaio 1;28(1):33-6. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10592175
- Sito della pagina web del laboratorio Koonin: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/groups/koonin/
- Sito FTP ufficiale: ftp.ncbi.nih.gov/pub/wolf/COGs/COGsoft/ (sebbene al momento, il readme punti solo alla pagina di sourceforge)
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
C++
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/cogtriangles/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
